Neben der Qualitätssicherung und -verbesserung der fachdidaktischen Lehre hat das FDZ mit Schwerpunkten auf Gender Studies, Theaterdidaktik und Politische Bildung eine Forschungsoffensive mit inter- und transdisziplinären Zugängen initiiert. Es fördert den Dialog zwischen Fachwissenschaft und Fachdidaktik, ebenso jenen mit dem Institut für Bildungswissenschaft und anderen Fachdidaktischen Zentren der Universität. Ein besonderes Augenmerk wird auf Kooperationen mit Schulen, Schulbehörden und Einrichtungen der LehrerInnenaus- und -fortbildung gelegt.